Monographs:

• Fürst Nikolaus II. Esterházy und die Musik: Drei quellenkundliche Studien (Mitteilungen aus der Sammlung Privatstiftung Esterházy, 3). Eisenstadt: Esterházy Privatstiftung, 2015.
• Jacob Handl-Gallus. Werk - Überlieferung - Rezeption. Mit thematischem Katalog (Wiener Forum für ältere Musikgeschichte, 5). Tutzing: Hans Schneider, 2012.
• Die Bach-Quellen in Wien und Alt-Österreich, Katalog in zwei Bänden, ed. Christine Blanken v sodelovanju z Markom Motnikom (Leipziger Beiträge zur Bachforschung, 10). Hildesheim: Georg Olms, 2011.

Critical editions:

• Monumenta artis musicæ Sloveniæ, Suppl. 4: Jacobus Hándl-Gallus: Epicedion harmonicum / Undique flammatis, ed. Marc Desmet in Marko Motnik. Ljubljana: Založba ZRC, ZRC SAZU, 2015.
• Monumenta artis musicæ Sloveniæ, Suppl. 3: Georgius Prenner - Pyrenaeus Carniolus: Tri intabulacije za glasbila s tipkami / Three Motet-Intabulations. Ljubljana: Založba ZRC, ZRC SAZU, 2011.
• Monumenta artis musicæ Sloveniæ, zv. 55: Jacobus Hándl-Gallus: Priredbe skladb za glasbila s tipkami / Compositions in Keyboard Intabulations. Ljubljana: Založba ZRC, ZRC SAZU, 2009.

5 most relevant articles/chapters in the last 5 years (2019–2024):

• »Spregledani skladatelj Jožef Robert Zupan (1760–1819) in njegovo glasbeno delo«. Kronika: časopis za slovensko krajevno zgodovino 72, no. 2 (2024): 285–296. http://dx.doi.org/10.56420/kronika.72.2.05.
• »Med miti, legendami in dejstvi: dunajska dvorna kapela v času Jurija Slatkonje«. In: Jurij Slatkonja (1456-1522): od Kranjske do Dunaja, ed. by Lilijana Žnidaršič Golec and Metoda Kokole, Metoda, 105–122. Ljubljana: Slovenska matica : Založba ZRC, ZRC SAZU, 2023. https://doi.org/10.3986/9789610507901
• »Z opernega odra na cerkveni kor: kontrafakture v glasbenem arhivu proštijske cerkve sv. Jurija na Ptuju«. De musica disserenda 19, no. 1 (2023): 59–87. https://doi.org/10.3986/dmd19.1.03
• »Music in the Dominican Convent of Marenberg: in Search of Sources«. Bogoslovni vestnik: glasilo Teološke fakultete v Ljubljani 83, no. 2 (2023): 449–464. https://www.teof.uni-lj.si/uploads/File/BV/BV2023/02/Motnik.pdf
• "Anselm Hüttenbrenner in Lower Styria (1853–1858)." De musica disserenda, 18, no. 1–2 (2022): 77–126. https://doi.org/10.3986/dmd18.1-2.02
• Das Oratorium ‘Il ritorno di Tobia’ von Joseph Haydn – ‘ein veraltetes Machwerk’? In: Original – Interpretation – Rezeption. Referate dreier Haydntagungen, ed. Walter Reicher (Eisenstädter Haydn-Berichte, 12), 175–196. Wien: Hollitzer Verlag, 2020. http://www.hollitzer.at/wissenschaft/programm/produktdetail/programm/eisenstaedter-haydn-berichte/produkt/original-interpretation-rezeption-referate-dreier-haydntagungen.html

5 most relevant earlier articles/chapters:

• Georg Link und seine Tanzschule von 1796. De musica disserenda 10/2 (2014): 33–55 (v soavtorstvu s Pio Brocza). https://ojs.zrc-sazu.si/dmd/article/view/1983
• Ludwig Senfl auf Tasteninstrumenten. Bestand – Befund – Bedeutung. In: Senfl-Studien 2, ur. Stefan Gasch in Sonja Tröster (Wiener Forum für ältere Musikgeschichte 7), 421–446. Tutzing: Hans Schneider, 2013. https://www.jstor.org/stable/j.ctvg8p2j0
• Das kompositorische Schaffen des Propstes Georg II. Prenner und die Pflege der Figuralmusik im Stift Herzogenburg des ausgehenden 16. Jahrhunderts. In: 900 Jahre Stift Herzogenburg. Aufbrüche, Umbrüche, Kontinuität. Tagungsband zum wissenschaftlichen Symposium vom 22.–24. September 2011, ur. Günter Katzler in Victoria Zimmerl-Panagl, 213–235. Innsbruck, Wien, Bozen: Studienverlag, 2013. https://www.studienverlag.at/buecher/5328/900-jahre-stift-herzogenburg/
• Das Tabulaturbuch Mus. ms. 40115 der Biblioteka Jagiellońska in Kraków – ein didaktisches Lehrwerk? Musicologica Istropolitana 10–11 (2013): 445–467. https://fphil.uniba.sk/fileadmin/fif/katedry_pracoviska/kmuz/Musicologica_Istropolitana/Musicologica_X-XI_final.pdf
• Georg Prenner. Skladateljski prispevek polifoniji 16. stoletja. In: Zgodovina glasbe na Slovenskem I. Glasba na Slovenskem do konca 16. stoletja, ed. Jurij Snoj, 377–390. Ljubljana: Založba ZRC, 2013. https://mi.zrc-sazu.si/sl/publikacije/zgodovina-glasbe-na-slovenskem-i#v

Marko Motnik graduated from the University of Music and Performing Arts, Vienna (MDW) with a Master's degree in organ performance and instrumental pedagogy, majoring in harpsichord. In 2010, following a programme of inter-university doctoral studies at the MDW and the University of Vienna, he received his doctorate with a dissertation on the work and reception history of Jacob Handl-Gallus. Dr. Motnik was employed as a university assistant within the Institute of Musicology at the University of Vienna from 2010 to 2014 and at the MDW from 2014 to 2016 as a research assistant for the research project Cultural Transfer of Music in Vienna, 1755-1780. He then worked on the cataloguing programme in the archives of the Gesellschaft der Musikfreunde in Vienna between 2016 and 2020. He contributed to various research projects for the Esterházy Private Foundation in Eisenstadt, for the Austrian Academy of Sciences, and the Saxon Academy of Sciences in Leipzig (Bach Archive). In October 2020, after a 25-year career in Vienna, he returned to his native Slovenia and joined the project Old Traditions in New Vestments: Musical and Textual Reworkings in the Performing Practices of Liturgical Music, under the direction of Katarina Šter.